Jedna igra oko koje Nintendovci zasigurno nisu bili oduševljeni tijekom njihove E3 prezentacije jest Metroid Prime: Federation Force. Scott Moffitt, potpredsjednik marketinškog ogranka američkog Nintenda osvrnuo se na feedback fanova za igru. Pažnja je svakako dobivena nakon pokrenute peticije za otkazivanjem igre koja je do danas skupila 20 tisuća potpisa. ”Volimo naše fanove, najstrastvenija su i najupečatljivija grupa fanova koju smo ikad vidjeli i pažljivo slušamo što nam imaju za reći” – rekao je Moffitt te nadodao da poštuju njihova mišljenja i njihovo pravo da ta mišljenja podijele s njima. ”Pokušavamo donijeti najbolje moguće odluke držeći na umu njihove komentare, naš sadržaj i našu franšizu. Puno faktora ulazi u obzir prije nego što se krene producirati neka igra. Neću se pretvarati da znam sve o svim odlukama, no svakako cijenimo entuzijazam fanova za ovu franšizu. Ja je također volim i nadam se da će ljudi pronaći nešto za sebe među drugih 14 igara koje smo predstavili na E3 sajmu kako bi si kratili čekanje igre koju svi toliko volimo i koju smo dugo čekali”.

Kritike fanova su zasnivane prvenstveno na činjenici da nova Metroid Prime igra odskače od tradicionalnog gameplaya karakterističnog za serijal, kao i činjenice da izlazi samo na 3DS konzoli dok je Wii U konzola zakinuta za svoju verziju. Hoće li se Nintendo predomisliti i krenuti u izradu Wii U verzije nakon svih ovih kritika, ostaje da vidimo.